Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPD1P62314 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD1P62314 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms