Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2FP61218 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2FP61218 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms