Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2MP61081 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2MP61081 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms