Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNAP25P60880 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAP25P60880 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms