Protein–RNA interactions for Protein: P57087

JAM2, Junctional adhesion molecule B, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM2P57087 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAM2P57087 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAM2P57087 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAM2P57087 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAM2P57087 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
JAM2P57087 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAM2P57087 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAM2P57087 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
JAM2P57087 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAM2P57087 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAM2P57087 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAM2P57087 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAM2P57087 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAM2P57087 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAM2P57087 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAM2P57087 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAM2P57087 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAM2P57087 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAM2P57087 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
JAM2P57087 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAM2P57087 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAM2P57087 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAM2P57087 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAM2P57087 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAM2P57087 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAM2P57087 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAM2P57087 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAM2P57087 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAM2P57087 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
JAM2P57087 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAM2P57087 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAM2P57087 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAM2P57087 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAM2P57087 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAM2P57087 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAM2P57087 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAM2P57087 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAM2P57087 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
JAM2P57087 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
JAM2P57087 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
JAM2P57087 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAM2P57087 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
JAM2P57087 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
JAM2P57087 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
JAM2P57087 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAM2P57087 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAM2P57087 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
JAM2P57087 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
JAM2P57087 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
JAM2P57087 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
JAM2P57087 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
JAM2P57087 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
JAM2P57087 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAM2P57087 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAM2P57087 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAM2P57087 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAM2P57087 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAM2P57087 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAM2P57087 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAM2P57087 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAM2P57087 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAM2P57087 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAM2P57087 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAM2P57087 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
JAM2P57087 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
JAM2P57087 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
JAM2P57087 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms