Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WNT3AP56704 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
WNT3AP56704 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms