Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNQ4P56696 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNQ4P56696 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms