Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX10P56693 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX10P56693 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX10P56693 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX10P56693 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX10P56693 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX10P56693 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX10P56693 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX10P56693 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX10P56693 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX10P56693 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX10P56693 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX10P56693 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX10P56693 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX10P56693 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX10P56693 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX10P56693 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX10P56693 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX10P56693 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX10P56693 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX10P56693 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX10P56693 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX10P56693 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX10P56693 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX10P56693 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX10P56693 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX10P56693 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX10P56693 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX10P56693 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX10P56693 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX10P56693 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX10P56693 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX10P56693 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX10P56693 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX10P56693 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX10P56693 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX10P56693 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX10P56693 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX10P56693 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX10P56693 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX10P56693 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX10P56693 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SOX10P56693 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SOX10P56693 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SOX10P56693 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX10P56693 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX10P56693 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX10P56693 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX10P56693 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX10P56693 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX10P56693 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX10P56693 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX10P56693 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX10P56693 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX10P56693 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX10P56693 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX10P56693 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX10P56693 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX10P56693 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX10P56693 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX10P56693 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX10P56693 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX10P56693 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX10P56693 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX10P56693 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX10P56693 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX10P56693 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX10P56693 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX10P56693 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX10P56693 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX10P56693 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX10P56693 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX10P56693 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX10P56693 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX10P56693 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX10P56693 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX10P56693 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX10P56693 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX10P56693 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX10P56693 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX10P56693 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX10P56693 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX10P56693 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms