Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms