Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHBP55084 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHBP55084 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHBP55084 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHBP55084 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHBP55084 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHBP55084 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHBP55084 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHBP55084 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHBP55084 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHBP55084 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHBP55084 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HADHBP55084 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HADHBP55084 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HADHBP55084 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HADHBP55084 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HADHBP55084 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HADHBP55084 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HADHBP55084 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HADHBP55084 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HADHBP55084 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HADHBP55084 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HADHBP55084 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HADHBP55084 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HADHBP55084 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HADHBP55084 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HADHBP55084 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HADHBP55084 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HADHBP55084 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HADHBP55084 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HADHBP55084 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HADHBP55084 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HADHBP55084 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HADHBP55084 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HADHBP55084 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HADHBP55084 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HADHBP55084 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HADHBP55084 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HADHBP55084 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HADHBP55084 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HADHBP55084 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HADHBP55084 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HADHBP55084 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HADHBP55084 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HADHBP55084 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HADHBP55084 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HADHBP55084 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HADHBP55084 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HADHBP55084 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HADHBP55084 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HADHBP55084 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HADHBP55084 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HADHBP55084 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HADHBP55084 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HADHBP55084 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HADHBP55084 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HADHBP55084 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HADHBP55084 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HADHBP55084 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HADHBP55084 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HADHBP55084 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HADHBP55084 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HADHBP55084 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HADHBP55084 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HADHBP55084 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HADHBP55084 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HADHBP55084 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HADHBP55084 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HADHBP55084 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HADHBP55084 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HADHBP55084 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HADHBP55084 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HADHBP55084 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HADHBP55084 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HADHBP55084 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HADHBP55084 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HADHBP55084 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HADHBP55084 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HADHBP55084 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HADHBP55084 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HADHBP55084 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HADHBP55084 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HADHBP55084 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HADHBP55084 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HADHBP55084 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HADHBP55084 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HADHBP55084 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HADHBP55084 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HADHBP55084 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HADHBP55084 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HADHBP55084 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HADHBP55084 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HADHBP55084 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HADHBP55084 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HADHBP55084 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HADHBP55084 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HADHBP55084 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HADHBP55084 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HADHBP55084 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HADHBP55084 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms