Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN5P54829 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN5P54829 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms