Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD23AP54725 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms