Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNB3P54284 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CACNB3P54284 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms