Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN3P54252 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN3P54252 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms