Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCR5P51681 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCR5P51681 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCR5P51681 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCR5P51681 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCR5P51681 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR5P51681 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR5P51681 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR5P51681 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR5P51681 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR5P51681 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR5P51681 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR5P51681 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR5P51681 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR5P51681 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR5P51681 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCR5P51681 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR5P51681 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR5P51681 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR5P51681 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR5P51681 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR5P51681 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR5P51681 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR5P51681 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR5P51681 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCR5P51681 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCR5P51681 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCR5P51681 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCR5P51681 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR5P51681 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR5P51681 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR5P51681 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR5P51681 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR5P51681 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR5P51681 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR5P51681 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR5P51681 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR5P51681 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR5P51681 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR5P51681 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR5P51681 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR5P51681 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCR5P51681 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR5P51681 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR5P51681 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR5P51681 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR5P51681 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR5P51681 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR5P51681 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR5P51681 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR5P51681 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR5P51681 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR5P51681 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR5P51681 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR5P51681 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCR5P51681 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR5P51681 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR5P51681 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR5P51681 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR5P51681 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR5P51681 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR5P51681 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCR5P51681 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR5P51681 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR5P51681 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR5P51681 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR5P51681 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR5P51681 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR5P51681 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR5P51681 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR5P51681 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR5P51681 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR5P51681 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR5P51681 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR5P51681 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR5P51681 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR5P51681 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCR5P51681 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCR5P51681 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCR5P51681 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCR5P51681 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCR5P51681 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCR5P51681 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCR5P51681 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms