Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB28P51157 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB28P51157 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB28P51157 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB28P51157 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB28P51157 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB28P51157 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB28P51157 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB28P51157 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB28P51157 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB28P51157 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB28P51157 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB28P51157 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB28P51157 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RAB28P51157 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB28P51157 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB28P51157 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB28P51157 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB28P51157 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB28P51157 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB28P51157 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB28P51157 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB28P51157 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB28P51157 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB28P51157 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB28P51157 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB28P51157 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB28P51157 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB28P51157 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB28P51157 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB28P51157 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB28P51157 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB28P51157 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB28P51157 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB28P51157 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB28P51157 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB28P51157 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB28P51157 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB28P51157 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB28P51157 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB28P51157 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB28P51157 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB28P51157 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB28P51157 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB28P51157 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB28P51157 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB28P51157 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB28P51157 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB28P51157 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB28P51157 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB28P51157 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB28P51157 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB28P51157 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB28P51157 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB28P51157 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB28P51157 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB28P51157 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB28P51157 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB28P51157 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB28P51157 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB28P51157 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB28P51157 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB28P51157 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB28P51157 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB28P51157 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB28P51157 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB28P51157 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB28P51157 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB28P51157 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB28P51157 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB28P51157 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB28P51157 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB28P51157 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB28P51157 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB28P51157 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB28P51157 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB28P51157 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB28P51157 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB28P51157 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB28P51157 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB28P51157 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB28P51157 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms