Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERFP50548 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERFP50548 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERFP50548 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERFP50548 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERFP50548 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERFP50548 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERFP50548 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERFP50548 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERFP50548 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERFP50548 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERFP50548 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERFP50548 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERFP50548 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERFP50548 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERFP50548 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERFP50548 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERFP50548 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERFP50548 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERFP50548 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERFP50548 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERFP50548 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERFP50548 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERFP50548 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERFP50548 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERFP50548 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERFP50548 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERFP50548 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERFP50548 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ERFP50548 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ERFP50548 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERFP50548 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERFP50548 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERFP50548 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERFP50548 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERFP50548 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERFP50548 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERFP50548 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERFP50548 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERFP50548 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERFP50548 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERFP50548 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERFP50548 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERFP50548 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERFP50548 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERFP50548 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERFP50548 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERFP50548 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERFP50548 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERFP50548 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERFP50548 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERFP50548 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERFP50548 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERFP50548 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERFP50548 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERFP50548 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERFP50548 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERFP50548 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERFP50548 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERFP50548 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERFP50548 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERFP50548 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERFP50548 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERFP50548 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERFP50548 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERFP50548 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERFP50548 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERFP50548 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERFP50548 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERFP50548 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERFP50548 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERFP50548 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERFP50548 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERFP50548 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERFP50548 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERFP50548 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERFP50548 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERFP50548 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERFP50548 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERFP50548 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERFP50548 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERFP50548 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERFP50548 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERFP50548 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms