Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTBP49356 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTBP49356 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTBP49356 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTBP49356 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTBP49356 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTBP49356 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNTBP49356 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTBP49356 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTBP49356 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTBP49356 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTBP49356 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTBP49356 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTBP49356 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTBP49356 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTBP49356 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTBP49356 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNTBP49356 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FNTBP49356 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTBP49356 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTBP49356 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTBP49356 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTBP49356 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTBP49356 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTBP49356 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTBP49356 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTBP49356 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FNTBP49356 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTBP49356 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTBP49356 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTBP49356 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTBP49356 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTBP49356 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTBP49356 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTBP49356 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNTBP49356 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTBP49356 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTBP49356 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTBP49356 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTBP49356 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTBP49356 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTBP49356 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNTBP49356 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTBP49356 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTBP49356 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTBP49356 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTBP49356 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTBP49356 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTBP49356 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTBP49356 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTBP49356 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTBP49356 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTBP49356 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTBP49356 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNTBP49356 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTBP49356 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTBP49356 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTBP49356 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTBP49356 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTBP49356 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTBP49356 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTBP49356 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTBP49356 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTBP49356 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTBP49356 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTBP49356 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTBP49356 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNTBP49356 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTBP49356 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTBP49356 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTBP49356 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTBP49356 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTBP49356 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTBP49356 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTBP49356 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTBP49356 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTBP49356 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTBP49356 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTBP49356 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTBP49356 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNTBP49356 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNTBP49356 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNTBP49356 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTBP49356 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTBP49356 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTBP49356 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTBP49356 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTBP49356 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTBP49356 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTBP49356 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTBP49356 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTBP49356 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTBP49356 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTBP49356 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTBP49356 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTBP49356 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTBP49356 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTBP49356 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTBP49356 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTBP49356 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms