Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTDSS1P48651 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTDSS1P48651 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms