Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNC1P48547 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC1P48547 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms