Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLMP48507 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLMP48507 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLMP48507 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLMP48507 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLMP48507 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLMP48507 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLMP48507 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLMP48507 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLMP48507 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLMP48507 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLMP48507 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLMP48507 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLMP48507 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLMP48507 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLMP48507 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLMP48507 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLMP48507 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLMP48507 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLMP48507 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLMP48507 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLMP48507 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLMP48507 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLMP48507 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLMP48507 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLMP48507 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLMP48507 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLMP48507 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLMP48507 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCLMP48507 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCLMP48507 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCLMP48507 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCLMP48507 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCLMP48507 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCLMP48507 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCLMP48507 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCLMP48507 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLMP48507 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLMP48507 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLMP48507 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLMP48507 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLMP48507 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLMP48507 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLMP48507 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLMP48507 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLMP48507 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLMP48507 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLMP48507 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLMP48507 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLMP48507 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLMP48507 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLMP48507 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLMP48507 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLMP48507 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLMP48507 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLMP48507 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLMP48507 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLMP48507 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLMP48507 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLMP48507 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLMP48507 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLMP48507 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLMP48507 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLMP48507 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLMP48507 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLMP48507 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLMP48507 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLMP48507 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLMP48507 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLMP48507 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLMP48507 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLMP48507 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLMP48507 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLMP48507 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLMP48507 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLMP48507 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLMP48507 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLMP48507 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLMP48507 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLMP48507 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLMP48507 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLMP48507 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.1 ms