Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA4P48058 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms