Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNJ1P48048 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNJ1P48048 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms