Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UTRNP46939 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UTRNP46939 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UTRNP46939 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UTRNP46939 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UTRNP46939 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UTRNP46939 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UTRNP46939 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UTRNP46939 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UTRNP46939 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UTRNP46939 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UTRNP46939 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UTRNP46939 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UTRNP46939 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UTRNP46939 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UTRNP46939 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UTRNP46939 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UTRNP46939 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UTRNP46939 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UTRNP46939 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UTRNP46939 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
UTRNP46939 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
UTRNP46939 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UTRNP46939 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UTRNP46939 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UTRNP46939 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
UTRNP46939 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UTRNP46939 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UTRNP46939 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UTRNP46939 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UTRNP46939 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UTRNP46939 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UTRNP46939 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UTRNP46939 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UTRNP46939 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UTRNP46939 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UTRNP46939 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UTRNP46939 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UTRNP46939 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UTRNP46939 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UTRNP46939 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UTRNP46939 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UTRNP46939 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UTRNP46939 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UTRNP46939 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UTRNP46939 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UTRNP46939 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UTRNP46939 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UTRNP46939 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UTRNP46939 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UTRNP46939 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UTRNP46939 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UTRNP46939 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UTRNP46939 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UTRNP46939 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UTRNP46939 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UTRNP46939 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UTRNP46939 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UTRNP46939 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
UTRNP46939 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UTRNP46939 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UTRNP46939 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UTRNP46939 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UTRNP46939 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UTRNP46939 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UTRNP46939 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UTRNP46939 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
UTRNP46939 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
UTRNP46939 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UTRNP46939 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UTRNP46939 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UTRNP46939 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UTRNP46939 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UTRNP46939 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UTRNP46939 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UTRNP46939 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UTRNP46939 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UTRNP46939 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UTRNP46939 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UTRNP46939 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
UTRNP46939 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UTRNP46939 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UTRNP46939 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UTRNP46939 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UTRNP46939 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UTRNP46939 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UTRNP46939 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UTRNP46939 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UTRNP46939 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UTRNP46939 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UTRNP46939 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UTRNP46939 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UTRNP46939 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UTRNP46939 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UTRNP46939 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UTRNP46939 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UTRNP46939 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UTRNP46939 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UTRNP46939 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UTRNP46939 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms