Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL21P46778 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL21P46778 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL21P46778 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL21P46778 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL21P46778 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL21P46778 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL21P46778 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL21P46778 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL21P46778 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL21P46778 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL21P46778 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL21P46778 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL21P46778 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL21P46778 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL21P46778 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL21P46778 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL21P46778 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL21P46778 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL21P46778 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL21P46778 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL21P46778 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL21P46778 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL21P46778 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL21P46778 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL21P46778 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL21P46778 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL21P46778 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL21P46778 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL21P46778 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL21P46778 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL21P46778 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL21P46778 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL21P46778 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL21P46778 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL21P46778 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL21P46778 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL21P46778 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL21P46778 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL21P46778 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL21P46778 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL21P46778 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL21P46778 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL21P46778 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL21P46778 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL21P46778 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL21P46778 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL21P46778 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL21P46778 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL21P46778 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL21P46778 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL21P46778 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL21P46778 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL21P46778 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL21P46778 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL21P46778 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL21P46778 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL21P46778 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL21P46778 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL21P46778 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL21P46778 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL21P46778 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL21P46778 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL21P46778 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL21P46778 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL21P46778 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL21P46778 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL21P46778 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL21P46778 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL21P46778 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL21P46778 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL21P46778 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL21P46778 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL21P46778 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL21P46778 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL21P46778 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL21P46778 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL21P46778 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL21P46778 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL21P46778 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL21P46778 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL21P46778 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL21P46778 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms