Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP2P46087 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOP2P46087 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOP2P46087 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOP2P46087 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOP2P46087 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOP2P46087 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOP2P46087 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOP2P46087 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOP2P46087 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOP2P46087 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOP2P46087 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP2P46087 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP2P46087 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP2P46087 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP2P46087 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP2P46087 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP2P46087 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP2P46087 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP2P46087 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP2P46087 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP2P46087 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP2P46087 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP2P46087 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP2P46087 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP2P46087 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP2P46087 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP2P46087 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP2P46087 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP2P46087 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP2P46087 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP2P46087 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP2P46087 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP2P46087 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP2P46087 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP2P46087 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP2P46087 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP2P46087 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP2P46087 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP2P46087 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP2P46087 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP2P46087 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP2P46087 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NOP2P46087 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NOP2P46087 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NOP2P46087 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP2P46087 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP2P46087 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP2P46087 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP2P46087 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP2P46087 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP2P46087 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP2P46087 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP2P46087 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP2P46087 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP2P46087 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP2P46087 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP2P46087 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP2P46087 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP2P46087 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP2P46087 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP2P46087 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP2P46087 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP2P46087 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP2P46087 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP2P46087 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms