Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR1P43307 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR1P43307 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR1P43307 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR1P43307 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR1P43307 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR1P43307 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR1P43307 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR1P43307 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR1P43307 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR1P43307 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR1P43307 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR1P43307 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR1P43307 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR1P43307 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR1P43307 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR1P43307 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR1P43307 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR1P43307 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR1P43307 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR1P43307 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR1P43307 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR1P43307 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR1P43307 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR1P43307 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR1P43307 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR1P43307 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR1P43307 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR1P43307 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR1P43307 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR1P43307 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR1P43307 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR1P43307 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR1P43307 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR1P43307 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR1P43307 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR1P43307 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR1P43307 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR1P43307 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR1P43307 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR1P43307 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR1P43307 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR1P43307 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR1P43307 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR1P43307 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR1P43307 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR1P43307 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR1P43307 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR1P43307 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR1P43307 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR1P43307 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR1P43307 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR1P43307 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR1P43307 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR1P43307 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR1P43307 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR1P43307 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR1P43307 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR1P43307 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR1P43307 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR1P43307 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR1P43307 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR1P43307 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR1P43307 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR1P43307 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR1P43307 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR1P43307 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR1P43307 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR1P43307 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR1P43307 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR1P43307 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR1P43307 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR1P43307 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR1P43307 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR1P43307 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR1P43307 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR1P43307 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR1P43307 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR1P43307 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR1P43307 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR1P43307 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR1P43307 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR1P43307 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR1P43307 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms