Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MTHFRP42898 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MTHFRP42898 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms