Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSKP41240 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSKP41240 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSKP41240 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSKP41240 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSKP41240 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSKP41240 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSKP41240 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSKP41240 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSKP41240 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSKP41240 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSKP41240 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSKP41240 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSKP41240 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSKP41240 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSKP41240 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSKP41240 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSKP41240 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSKP41240 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSKP41240 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSKP41240 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSKP41240 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSKP41240 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSKP41240 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSKP41240 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSKP41240 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSKP41240 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSKP41240 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSKP41240 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSKP41240 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSKP41240 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSKP41240 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSKP41240 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSKP41240 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSKP41240 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSKP41240 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSKP41240 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSKP41240 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSKP41240 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSKP41240 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSKP41240 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSKP41240 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSKP41240 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSKP41240 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSKP41240 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSKP41240 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSKP41240 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSKP41240 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSKP41240 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSKP41240 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSKP41240 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSKP41240 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSKP41240 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSKP41240 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSKP41240 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSKP41240 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSKP41240 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSKP41240 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSKP41240 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSKP41240 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSKP41240 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSKP41240 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSKP41240 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSKP41240 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSKP41240 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSKP41240 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSKP41240 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSKP41240 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSKP41240 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms