Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
THPOP40225 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THPOP40225 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THPOP40225 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THPOP40225 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THPOP40225 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THPOP40225 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THPOP40225 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THPOP40225 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THPOP40225 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
THPOP40225 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THPOP40225 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THPOP40225 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THPOP40225 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THPOP40225 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THPOP40225 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THPOP40225 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THPOP40225 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THPOP40225 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THPOP40225 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THPOP40225 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THPOP40225 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THPOP40225 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
THPOP40225 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
THPOP40225 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THPOP40225 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THPOP40225 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THPOP40225 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THPOP40225 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THPOP40225 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THPOP40225 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THPOP40225 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THPOP40225 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THPOP40225 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THPOP40225 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THPOP40225 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THPOP40225 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THPOP40225 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THPOP40225 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
THPOP40225 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THPOP40225 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THPOP40225 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THPOP40225 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THPOP40225 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THPOP40225 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THPOP40225 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THPOP40225 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THPOP40225 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THPOP40225 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THPOP40225 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THPOP40225 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THPOP40225 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THPOP40225 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THPOP40225 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
THPOP40225 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THPOP40225 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
THPOP40225 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THPOP40225 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THPOP40225 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THPOP40225 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THPOP40225 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THPOP40225 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THPOP40225 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THPOP40225 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THPOP40225 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THPOP40225 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THPOP40225 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THPOP40225 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THPOP40225 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THPOP40225 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THPOP40225 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THPOP40225 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THPOP40225 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THPOP40225 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THPOP40225 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THPOP40225 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THPOP40225 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THPOP40225 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THPOP40225 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THPOP40225 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THPOP40225 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
THPOP40225 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THPOP40225 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THPOP40225 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THPOP40225 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THPOP40225 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THPOP40225 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THPOP40225 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THPOP40225 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THPOP40225 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THPOP40225 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THPOP40225 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THPOP40225 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THPOP40225 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THPOP40225 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
THPOP40225 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THPOP40225 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THPOP40225 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THPOP40225 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
THPOP40225 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms