Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJC1P36383 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJC1P36383 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJC1P36383 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJC1P36383 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJC1P36383 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJC1P36383 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJC1P36383 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJC1P36383 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJC1P36383 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJC1P36383 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJC1P36383 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJC1P36383 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJC1P36383 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJC1P36383 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJC1P36383 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJC1P36383 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJC1P36383 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJC1P36383 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJC1P36383 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJC1P36383 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJC1P36383 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJC1P36383 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJC1P36383 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC1P36383 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC1P36383 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC1P36383 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC1P36383 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC1P36383 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC1P36383 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC1P36383 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC1P36383 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJC1P36383 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJC1P36383 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJC1P36383 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJC1P36383 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJC1P36383 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJC1P36383 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJC1P36383 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJC1P36383 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJC1P36383 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJC1P36383 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJC1P36383 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJC1P36383 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC1P36383 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC1P36383 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC1P36383 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC1P36383 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC1P36383 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC1P36383 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC1P36383 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC1P36383 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJC1P36383 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC1P36383 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC1P36383 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC1P36383 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC1P36383 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC1P36383 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC1P36383 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC1P36383 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC1P36383 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJC1P36383 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC1P36383 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC1P36383 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC1P36383 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC1P36383 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC1P36383 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC1P36383 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC1P36383 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC1P36383 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC1P36383 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC1P36383 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC1P36383 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC1P36383 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC1P36383 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GJC1P36383 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJC1P36383 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJC1P36383 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJC1P36383 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJC1P36383 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJC1P36383 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GJC1P36383 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms