Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX5P35711 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX5P35711 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX5P35711 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX5P35711 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX5P35711 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX5P35711 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOX5P35711 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX5P35711 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX5P35711 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX5P35711 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX5P35711 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX5P35711 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX5P35711 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX5P35711 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX5P35711 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX5P35711 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX5P35711 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX5P35711 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOX5P35711 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOX5P35711 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX5P35711 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX5P35711 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX5P35711 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOX5P35711 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX5P35711 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX5P35711 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX5P35711 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX5P35711 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX5P35711 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOX5P35711 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX5P35711 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX5P35711 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX5P35711 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX5P35711 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX5P35711 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX5P35711 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX5P35711 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX5P35711 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX5P35711 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX5P35711 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOX5P35711 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX5P35711 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX5P35711 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX5P35711 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX5P35711 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX5P35711 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX5P35711 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX5P35711 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX5P35711 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX5P35711 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOX5P35711 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX5P35711 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX5P35711 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX5P35711 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX5P35711 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX5P35711 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX5P35711 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX5P35711 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX5P35711 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX5P35711 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX5P35711 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX5P35711 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX5P35711 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX5P35711 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOX5P35711 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms