Protein–RNA interactions for Protein: P34096

RNASE4, Ribonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASE4P34096 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RNASE4P34096 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNASE4P34096 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms