Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLIP1P30622 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLIP1P30622 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms