Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECHS1P30084 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECHS1P30084 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECHS1P30084 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms