Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB2P29323 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms