Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMLP26374 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMLP26374 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMLP26374 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMLP26374 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMLP26374 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMLP26374 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMLP26374 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMLP26374 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMLP26374 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMLP26374 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMLP26374 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMLP26374 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMLP26374 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMLP26374 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMLP26374 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMLP26374 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMLP26374 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMLP26374 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMLP26374 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMLP26374 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMLP26374 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMLP26374 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMLP26374 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMLP26374 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMLP26374 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMLP26374 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMLP26374 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMLP26374 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMLP26374 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMLP26374 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMLP26374 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMLP26374 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMLP26374 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMLP26374 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMLP26374 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMLP26374 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMLP26374 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMLP26374 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMLP26374 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMLP26374 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMLP26374 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHMLP26374 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMLP26374 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMLP26374 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMLP26374 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMLP26374 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMLP26374 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMLP26374 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMLP26374 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMLP26374 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMLP26374 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMLP26374 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CHMLP26374 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMLP26374 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMLP26374 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMLP26374 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMLP26374 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMLP26374 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMLP26374 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMLP26374 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMLP26374 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMLP26374 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMLP26374 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMLP26374 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMLP26374 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMLP26374 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMLP26374 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMLP26374 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMLP26374 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMLP26374 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMLP26374 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMLP26374 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMLP26374 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMLP26374 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMLP26374 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMLP26374 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMLP26374 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMLP26374 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMLP26374 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMLP26374 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMLP26374 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMLP26374 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMLP26374 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMLP26374 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMLP26374 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHMLP26374 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHMLP26374 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHMLP26374 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHMLP26374 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms