Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA3P26006 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms