Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTAFRP25105 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms