Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDELR1P24390 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR1P24390 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDELR1P24390 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms