Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF4BP23588 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4BP23588 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms