Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPRBP23467 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PTPRBP23467 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PTPRBP23467 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PTPRBP23467 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRBP23467 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
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