Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLDCP23378 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLDCP23378 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLDCP23378 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLDCP23378 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLDCP23378 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GLDCP23378 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLDCP23378 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLDCP23378 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLDCP23378 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLDCP23378 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLDCP23378 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLDCP23378 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLDCP23378 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLDCP23378 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLDCP23378 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GLDCP23378 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLDCP23378 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLDCP23378 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLDCP23378 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GLDCP23378 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLDCP23378 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GLDCP23378 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLDCP23378 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLDCP23378 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLDCP23378 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLDCP23378 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GLDCP23378 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLDCP23378 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLDCP23378 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLDCP23378 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLDCP23378 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLDCP23378 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLDCP23378 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GLDCP23378 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLDCP23378 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GLDCP23378 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLDCP23378 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLDCP23378 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLDCP23378 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLDCP23378 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLDCP23378 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLDCP23378 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLDCP23378 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLDCP23378 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLDCP23378 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLDCP23378 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLDCP23378 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLDCP23378 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLDCP23378 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLDCP23378 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLDCP23378 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLDCP23378 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GLDCP23378 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLDCP23378 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLDCP23378 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLDCP23378 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLDCP23378 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLDCP23378 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLDCP23378 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLDCP23378 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLDCP23378 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLDCP23378 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GLDCP23378 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLDCP23378 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLDCP23378 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLDCP23378 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLDCP23378 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLDCP23378 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLDCP23378 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GLDCP23378 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLDCP23378 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLDCP23378 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GLDCP23378 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLDCP23378 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLDCP23378 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLDCP23378 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLDCP23378 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLDCP23378 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLDCP23378 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLDCP23378 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLDCP23378 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLDCP23378 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GLDCP23378 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLDCP23378 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLDCP23378 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLDCP23378 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLDCP23378 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLDCP23378 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLDCP23378 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLDCP23378 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLDCP23378 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLDCP23378 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLDCP23378 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLDCP23378 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLDCP23378 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLDCP23378 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GLDCP23378 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GLDCP23378 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLDCP23378 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms