Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HRCP23327 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
HRCP23327 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HRCP23327 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HRCP23327 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
HRCP23327 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HRCP23327 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HRCP23327 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HRCP23327 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HRCP23327 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HRCP23327 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HRCP23327 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HRCP23327 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HRCP23327 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HRCP23327 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HRCP23327 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HRCP23327 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HRCP23327 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
HRCP23327 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
HRCP23327 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HRCP23327 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HRCP23327 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HRCP23327 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HRCP23327 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HRCP23327 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HRCP23327 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HRCP23327 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HRCP23327 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HRCP23327 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HRCP23327 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
HRCP23327 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
HRCP23327 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HRCP23327 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HRCP23327 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HRCP23327 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HRCP23327 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HRCP23327 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HRCP23327 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HRCP23327 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HRCP23327 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HRCP23327 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HRCP23327 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HRCP23327 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HRCP23327 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HRCP23327 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HRCP23327 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HRCP23327 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HRCP23327 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HRCP23327 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HRCP23327 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HRCP23327 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HRCP23327 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HRCP23327 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HRCP23327 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HRCP23327 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HRCP23327 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HRCP23327 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HRCP23327 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HRCP23327 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HRCP23327 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HRCP23327 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HRCP23327 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HRCP23327 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HRCP23327 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HRCP23327 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HRCP23327 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
HRCP23327 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HRCP23327 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HRCP23327 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HRCP23327 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HRCP23327 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HRCP23327 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HRCP23327 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HRCP23327 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HRCP23327 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HRCP23327 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HRCP23327 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HRCP23327 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HRCP23327 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HRCP23327 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HRCP23327 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
HRCP23327 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
HRCP23327 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
HRCP23327 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HRCP23327 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HRCP23327 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HRCP23327 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HRCP23327 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HRCP23327 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HRCP23327 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HRCP23327 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HRCP23327 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HRCP23327 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HRCP23327 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HRCP23327 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HRCP23327 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HRCP23327 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HRCP23327 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HRCP23327 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HRCP23327 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms