Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA5P20719 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms