Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6GP18545 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6GP18545 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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