Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCLP18206 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VCLP18206 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCLP18206 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCLP18206 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCLP18206 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCLP18206 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCLP18206 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCLP18206 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VCLP18206 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCLP18206 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCLP18206 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCLP18206 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCLP18206 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCLP18206 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VCLP18206 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VCLP18206 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCLP18206 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCLP18206 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VCLP18206 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCLP18206 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCLP18206 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCLP18206 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCLP18206 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCLP18206 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCLP18206 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCLP18206 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VCLP18206 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCLP18206 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCLP18206 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCLP18206 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCLP18206 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCLP18206 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCLP18206 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCLP18206 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCLP18206 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCLP18206 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCLP18206 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCLP18206 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCLP18206 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCLP18206 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCLP18206 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCLP18206 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCLP18206 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCLP18206 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCLP18206 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms