Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC2P18074 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms