Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN1P18031 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN1P18031 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms