Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD1P17405 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMPD1P17405 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMPD1P17405 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms